# data_comp_list loop_ _chem_comp.id _chem_comp.three_letter_code _chem_comp.name _chem_comp.group _chem_comp.number_atoms_all _chem_comp.number_atoms_nh _chem_comp.desc_level XYS XYS 'D-Xylose ' D-pyranose 18 10 . # data_comp_XYS # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.type_energy _chem_comp_atom.partial_charge XYS C1 C C 0.000 XYS O1 O O 0.000 XYS C2 C CH1 0.000 XYS H2 H HCH1 0.000 XYS O2 O OH1 0.000 XYS HO2 H HOH1 0.000 XYS C3 C CH1 0.000 XYS H3 H HCH1 0.000 XYS O3 O OH1 0.000 XYS HO3 H HOH1 0.000 XYS C4 C CH1 0.000 XYS H4 H HCH1 0.000 XYS O4 O OH1 0.000 XYS HO4 H HOH1 0.000 XYS C5 C CH2 0.000 XYS H52 H HCH2 0.000 XYS H51 H HCH2 0.000 XYS O5 O O2 0.000 loop_ _chem_comp_tree.comp_id _chem_comp_tree.atom_id _chem_comp_tree.atom_back _chem_comp_tree.atom_forward _chem_comp_tree.connect_type XYS C1 n/a C2 START XYS O1 C1 . . XYS C2 C1 C3 . XYS H2 C2 . . XYS O2 C2 HO2 . XYS HO2 O2 . . XYS C3 C2 C4 . XYS H3 C3 . . XYS O3 C3 HO3 . XYS HO3 O3 . . XYS C4 C3 C5 . XYS H4 C4 . . XYS O4 C4 HO4 . XYS HO4 O4 . . XYS C5 C4 O5 . XYS H52 C5 . . XYS H51 C5 . . XYS O5 C5 . END XYS C1 O5 . ADD loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.type _chem_comp_bond.value_dist _chem_comp_bond.value_dist_esd XYS C2 C1 coval 1.500 0.020 XYS C3 C2 coval 1.524 0.020 XYS C4 C3 coval 1.524 0.020 XYS C5 C4 coval 1.524 0.020 XYS O1 C1 coval 1.410 0.020 XYS O2 C2 coval 1.410 0.020 XYS O3 C3 coval 1.410 0.020 XYS O4 C4 coval 1.410 0.020 XYS O5 C5 coval 1.410 0.020 XYS H2 C2 coval 1.090 0.020 XYS H3 C3 coval 1.090 0.020 XYS H4 C4 coval 1.090 0.020 XYS H51 C5 coval 1.090 0.020 XYS H52 C5 coval 1.090 0.020 XYS HO2 O2 coval 0.980 0.020 XYS HO3 O3 coval 0.980 0.020 XYS HO4 O4 coval 0.980 0.020 XYS C1 O5 coval 1.350 0.020 loop_ _chem_comp_angle.comp_id _chem_comp_angle.atom_id_1 _chem_comp_angle.atom_id_2 _chem_comp_angle.atom_id_3 _chem_comp_angle.value_angle _chem_comp_angle.value_angle_esd XYS O1 C1 C2 109.500 3.000 XYS O1 C1 O5 109.000 3.000 XYS C2 C1 O5 109.000 3.000 XYS C1 C2 H2 108.810 3.000 XYS C1 C2 O2 109.470 3.000 XYS C1 C2 C3 109.470 3.000 XYS H2 C2 O2 109.470 3.000 XYS O2 C2 C3 109.470 3.000 XYS C2 C3 H3 108.340 3.000 XYS C2 C3 O3 109.470 3.000 XYS C2 C3 C4 111.000 3.000 XYS H3 C3 O3 109.470 3.000 XYS O3 C3 C4 109.470 3.000 XYS C3 C4 H4 108.340 3.000 XYS C3 C4 O4 109.470 3.000 XYS C3 C4 C5 111.000 3.000 XYS H4 C4 O4 109.470 3.000 XYS O4 C4 C5 109.470 3.000 XYS C4 C5 H52 109.470 3.000 XYS C4 C5 H51 109.470 3.000 XYS C4 C5 O5 109.470 3.000 XYS H52 C5 H51 107.900 3.000 XYS H51 C5 O5 109.470 3.000 XYS C2 O2 HO2 109.470 3.000 XYS C3 O3 HO3 109.470 3.000 XYS C4 O4 HO4 109.470 3.000 XYS C5 O5 C1 111.800 3.000 loop_ _chem_comp_tor.comp_id _chem_comp_tor.id _chem_comp_tor.atom_id_1 _chem_comp_tor.atom_id_2 _chem_comp_tor.atom_id_3 _chem_comp_tor.atom_id_4 _chem_comp_tor.value_angle _chem_comp_tor.value_angle_esd _chem_comp_tor.period XYS var_1 C5 O5 C1 C2 -40.000 20.000 1 XYS var_2 O5 C1 C2 C3 60.000 20.000 1 XYS var_3 C1 C2 C3 C4 -60.000 20.000 1 XYS var_4 C2 C3 C4 C5 30.000 20.000 1 XYS var_5 C3 C4 C5 O5 0.000 20.000 1 XYS var_6 C1 C2 O2 HO2 0.000 20.000 1 XYS var_7 C2 C3 O3 HO3 0.000 20.000 1 XYS var_8 C3 C4 O4 HO4 0.000 20.000 1 XYS var_9 C4 C5 O5 C1 0.000 20.000 1 loop_ _chem_comp_chir.comp_id _chem_comp_chir.id _chem_comp_chir.atom_id_centre _chem_comp_chir.atom_id_1 _chem_comp_chir.atom_id_2 _chem_comp_chir.atom_id_3 _chem_comp_chir.volume_sign XYS chir_01 C1 O5 O1 C2 both XYS chir_02 C2 C1 O2 C3 positiv XYS chir_03 C3 C2 O3 C4 negativ XYS chir_04 C4 C3 O4 C5 positiv