# data_comp_list loop_ _chem_comp.id _chem_comp.three_letter_code _chem_comp.name _chem_comp.group _chem_comp.number_atoms_all _chem_comp.number_atoms_nh _chem_comp.desc_level UFP . '5-FLUORO-2*-DEOXYURIDINE-5*-MONOPHOS' non-polymer 33 21 . # data_comp_UFP # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.type_energy _chem_comp_atom.partial_charge UFP O1P O OP 0.000 UFP P P P 0.000 UFP O2P O OH1 0.000 UFP HOP2 H HOH1 0.000 UFP O3P O OH1 0.000 UFP HOP3 H HOH1 0.000 UFP O5* O O2 0.000 UFP C5* C CH2 0.000 UFP H5*1 H HCH2 0.000 UFP H5*2 H HCH2 0.000 UFP C4* C CH1 0.000 UFP H4* H HCH1 0.000 UFP O4* O O2 0.000 UFP C3* C CH1 0.000 UFP H3* H HCH1 0.000 UFP O3* O OH1 0.000 UFP HO3* H HOH1 0.000 UFP C2* C CH2 0.000 UFP H2*1 H HCH2 0.000 UFP H2*2 H HCH2 0.000 UFP C1* C CH1 0.000 UFP H1* H HCH1 0.000 UFP N1 N NR6 0.000 UFP C2 C CR6 0.000 UFP O2 O O 0.000 UFP N3 N NR16 0.000 UFP HN3 H HNR6 0.000 UFP C4 C CR6 0.000 UFP O4 O O 0.000 UFP C5 C CR6 0.000 UFP F5 F F 0.000 UFP C6 C CR16 0.000 UFP H6 H HCR6 0.000 loop_ _chem_comp_tree.comp_id _chem_comp_tree.atom_id _chem_comp_tree.atom_back _chem_comp_tree.atom_forward _chem_comp_tree.connect_type UFP O1P n/a P START UFP P O1P O5* . UFP O2P P HOP2 . UFP HOP2 O2P . . UFP O3P P HOP3 . UFP HOP3 O3P . . UFP O5* P C5* . UFP C5* O5* C4* . UFP H5*1 C5* . . UFP H5*2 C5* . . UFP C4* C5* C3* . UFP H4* C4* . . UFP O4* C4* . . UFP C3* C4* C2* . UFP H3* C3* . . UFP O3* C3* HO3* . UFP HO3* O3* . . UFP C2* C3* C1* . UFP H2*1 C2* . . UFP H2*2 C2* . . UFP C1* C2* N1 . UFP H1* C1* . . UFP N1 C1* C2 . UFP C2 N1 N3 . UFP O2 C2 . . UFP N3 C2 C4 . UFP HN3 N3 . . UFP C4 N3 C5 . UFP O4 C4 . . UFP C5 C4 C6 . UFP F5 C5 . . UFP C6 C5 H6 . UFP H6 C6 . END UFP N1 C6 . ADD UFP C1* O4* . ADD loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.type _chem_comp_bond.value_dist _chem_comp_bond.value_dist_esd UFP P O1P coval 1.480 0.020 UFP O2P P coval 1.480 0.020 UFP HOP2 O2P coval 0.980 0.020 UFP O3P P coval 1.480 0.020 UFP HOP3 O3P coval 0.980 0.020 UFP O5* P coval 1.610 0.020 UFP C5* O5* coval 1.410 0.020 UFP H5*1 C5* coval 1.090 0.020 UFP H5*2 C5* coval 1.090 0.020 UFP C4* C5* coval 1.524 0.020 UFP H4* C4* coval 1.090 0.020 UFP O4* C4* coval 1.410 0.020 UFP C3* C4* coval 1.524 0.020 UFP H3* C3* coval 1.090 0.020 UFP O3* C3* coval 1.410 0.020 UFP HO3* O3* coval 0.980 0.020 UFP C2* C3* coval 1.524 0.020 UFP H2*1 C2* coval 1.090 0.020 UFP H2*2 C2* coval 1.090 0.020 UFP C1* C2* coval 1.524 0.020 UFP C1* O4* coval 1.410 0.020 UFP H1* C1* coval 1.090 0.020 UFP N1 C1* coval 1.475 0.020 UFP N1 C6 coval 1.365 0.020 UFP C2 N1 coval 1.380 0.020 UFP O2 C2 coval 1.230 0.020 UFP N3 C2 coval 1.380 0.020 UFP HN3 N3 coval 1.040 0.020 UFP C4 N3 coval 1.380 0.020 UFP O4 C4 coval 1.230 0.020 UFP C5 C4 coval 1.390 0.020 UFP F5 C5 coval 1.360 0.020 UFP C6 C5 coval 1.390 0.020 UFP H6 C6 coval 1.090 0.020 loop_ _chem_comp_angle.comp_id _chem_comp_angle.atom_id_1 _chem_comp_angle.atom_id_2 _chem_comp_angle.atom_id_3 _chem_comp_angle.value_angle _chem_comp_angle.value_angle_esd UFP O1P P O2P 109.500 3.000 UFP O1P P O3P 109.500 3.000 UFP O1P P O5* 108.200 3.000 UFP O2P P O3P 109.500 3.000 UFP O2P P O5* 109.500 3.000 UFP O3P P O5* 109.500 3.000 UFP P O2P HOP2 120.000 3.000 UFP P O3P HOP3 120.000 3.000 UFP P O5* C5* 120.500 3.000 UFP O5* C5* H5*1 109.470 3.000 UFP O5* C5* H5*2 109.470 3.000 UFP O5* C5* C4* 109.470 3.000 UFP H5*1 C5* H5*2 107.900 3.000 UFP H5*1 C5* C4* 109.470 3.000 UFP H5*2 C5* C4* 109.470 3.000 UFP C5* C4* H4* 108.340 3.000 UFP C5* C4* O4* 109.470 3.000 UFP C5* C4* C3* 111.000 3.000 UFP H4* C4* O4* 109.470 3.000 UFP H4* C4* C3* 108.340 3.000 UFP O4* C4* C3* 109.470 3.000 UFP C4* O4* C1* 111.800 3.000 UFP C4* C3* H3* 108.340 3.000 UFP C4* C3* O3* 109.470 3.000 UFP C4* C3* C2* 111.000 3.000 UFP H3* C3* O3* 109.470 3.000 UFP H3* C3* C2* 108.340 3.000 UFP O3* C3* C2* 109.470 3.000 UFP C3* O3* HO3* 109.470 3.000 UFP C3* C2* H2*1 109.470 3.000 UFP C3* C2* H2*2 109.470 3.000 UFP C3* C2* C1* 111.000 3.000 UFP H2*1 C2* H2*2 107.900 3.000 UFP H2*1 C2* C1* 109.470 3.000 UFP H2*2 C2* C1* 109.470 3.000 UFP C2* C1* H1* 108.340 3.000 UFP C2* C1* N1 109.470 3.000 UFP C2* C1* O4* 109.470 3.000 UFP H1* C1* N1 109.470 3.000 UFP H1* C1* O4* 109.470 3.000 UFP N1 C1* O4* 109.470 3.000 UFP C1* N1 C2 120.000 3.000 UFP C1* N1 C6 120.000 3.000 UFP C2 N1 C6 120.000 3.000 UFP N1 C2 O2 120.000 3.000 UFP N1 C2 N3 120.000 3.000 UFP O2 C2 N3 120.000 3.000 UFP C2 N3 HN3 120.000 3.000 UFP C2 N3 C4 120.000 3.000 UFP HN3 N3 C4 120.000 3.000 UFP N3 C4 O4 120.000 3.000 UFP N3 C4 C5 120.000 3.000 UFP O4 C4 C5 120.000 3.000 UFP C4 C5 F5 120.000 3.000 UFP C4 C5 C6 120.000 3.000 UFP F5 C5 C6 120.000 3.000 UFP C5 C6 H6 120.000 3.000 UFP C5 C6 N1 120.000 3.000 UFP H6 C6 N1 120.000 3.000 loop_ _chem_comp_tor.comp_id _chem_comp_tor.id _chem_comp_tor.atom_id_1 _chem_comp_tor.atom_id_2 _chem_comp_tor.atom_id_3 _chem_comp_tor.atom_id_4 _chem_comp_tor.value_angle _chem_comp_tor.value_angle_esd _chem_comp_tor.period UFP var_1 O1P P O2P HOP2 0.000 20.000 1 UFP var_2 O1P P O3P HOP3 0.000 20.000 1 UFP var_3 O1P P O5* C5* -172.591 20.000 1 UFP var_4 P O5* C5* C4* 178.371 20.000 1 UFP var_5 O5* C5* C4* C3* -71.200 20.000 3 UFP var_6 C5* C4* O4* C1* 106.251 20.000 1 UFP var_7 C5* C4* C3* C2* -100.485 20.000 3 UFP var_8 C4* C3* O3* HO3* 0.000 20.000 1 UFP var_9 C4* C3* C2* C1* -21.216 20.000 3 UFP var_10 C3* C2* C1* N1 -172.971 20.000 3 UFP var_11 C3* C2* C1* O4* 4.535 20.000 3 UFP var_12 C2* C1* N1 C2 -65.538 20.000 1 UFP var_13 C2* C1* N1 C6 114.443 20.000 1 UFP CONST_1 C1* N1 C2 N3 180.000 0.000 0 UFP CONST_2 N1 C2 N3 C4 0.000 0.000 0 UFP CONST_3 C2 N3 C4 C5 0.000 0.000 0 UFP CONST_4 N3 C4 C5 C6 0.000 0.000 0 UFP CONST_5 C4 C5 C6 N1 0.000 0.000 0 loop_ _chem_comp_chir.comp_id _chem_comp_chir.id _chem_comp_chir.atom_id_centre _chem_comp_chir.atom_id_1 _chem_comp_chir.atom_id_2 _chem_comp_chir.atom_id_3 _chem_comp_chir.volume_sign UFP chir_01 C3* C2* C4* O3* negativ UFP chir_02 C4* C3* O4* C5* positiv UFP chir_03 C1* N1 C2* O4* positiv loop_ _chem_comp_plane_atom.comp_id _chem_comp_plane_atom.plane_id _chem_comp_plane_atom.atom_id _chem_comp_plane_atom.dist_esd UFP plan-1 N1 0.020 UFP plan-1 C2 0.020 UFP plan-1 C6 0.020 UFP plan-1 C1* 0.020 UFP plan-1 N3 0.020 UFP plan-1 C4 0.020 UFP plan-1 O4 0.020 UFP plan-1 F5 0.020 UFP plan-1 O2 0.020