# data_comp_list loop_ _chem_comp.id _chem_comp.three_letter_code _chem_comp.name _chem_comp.group _chem_comp.number_atoms_all _chem_comp.number_atoms_nh _chem_comp.desc_level LLP LLP 'LYSINE-PYRIDOXAL-5*-PHOSPHATE ' L-peptide 38 24 . # data_comp_LLP # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.type_energy _chem_comp_atom.partial_charge LLP N N NH1 -0.204 LLP H H HNH1 0.204 LLP CA C CH1 0.058 LLP HA H HCH1 0.046 LLP CB C CH2 -0.076 LLP HB1 H HCH2 0.038 LLP HB2 H HCH2 0.038 LLP CG C CH2 -0.076 LLP HG1 H HCH2 0.038 LLP HG2 H HCH2 0.038 LLP CD C CH2 -0.076 LLP HD1 H HCH2 0.038 LLP HD2 H HCH2 0.038 LLP CE C CH2 -0.013 LLP HE1 H HCH2 0.098 LLP HE2 H HCH2 0.098 LLP NZ N NT3 -0.506 LLP HZ1 H HNT3 0.441 LLP HZ2 H HNT3 0.441 LLP C4A C C 0.000 LLP C4 C CR6 0.000 LLP C3 C CR6 0.000 LLP O3 O O 0.000 LLP C2 C CR6 0.000 LLP C2A C C 0.000 LLP N1 N NR16 0.000 LLP HN1 H HNR6 0.000 LLP C5 C CR6 0.000 LLP C6 C CR16 0.000 LLP H6 H HCR6 0.000 LLP C5A C C 0.000 LLP O4P O O2 0.000 LLP P P P 0.000 LLP O1P O OP 0.000 LLP O2P O OP 0.000 LLP O3P O OP 0.000 LLP C C C 0.318 LLP O O O -0.422 loop_ _chem_comp_tree.comp_id _chem_comp_tree.atom_id _chem_comp_tree.atom_back _chem_comp_tree.atom_forward _chem_comp_tree.connect_type LLP N n/a CA START LLP H N . . LLP CA N C . LLP HA CA . . LLP CB CA CG . LLP HB1 CB . . LLP HB2 CB . . LLP CG CB CD . LLP HG1 CG . . LLP HG2 CG . . LLP CD CG CE . LLP HD1 CD . . LLP HD2 CD . . LLP CE CD NZ . LLP HE1 CE . . LLP HE2 CE . . LLP NZ CE C4A . LLP HZ1 NZ . . LLP HZ2 NZ . . LLP C4A NZ C4 . LLP C4 C4A C5 . LLP C3 C4 C2 . LLP O3 C3 . . LLP C2 C3 N1 . LLP C2A C2 . . LLP N1 C2 HN1 . LLP HN1 N1 . . LLP C5 C4 C5A . LLP C6 C5 H6 . LLP H6 C6 . . LLP C5A C5 O4P . LLP O4P C5A P . LLP P O4P O3P . LLP O1P P . . LLP O2P P . . LLP O3P P . . LLP C CA . END LLP O C . . LLP N1 C6 . ADD loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.type _chem_comp_bond.value_dist _chem_comp_bond.value_dist_esd LLP N H coval 0.860 0.020 LLP N CA coval 1.458 0.019 LLP CA HA coval 0.980 0.020 LLP CA CB coval 1.530 0.020 LLP CB HB1 coval 0.970 0.020 LLP CB HB2 coval 0.970 0.020 LLP CB CG coval 1.520 0.030 LLP CG HG1 coval 0.970 0.020 LLP CG HG2 coval 0.970 0.020 LLP CG CD coval 1.520 0.030 LLP CD HD1 coval 0.970 0.020 LLP CD HD2 coval 0.970 0.020 LLP CD CE coval 1.520 0.030 LLP CE HE1 coval 0.970 0.020 LLP CE HE2 coval 0.970 0.020 LLP CE NZ coval 1.489 0.030 LLP NZ HZ1 coval 0.960 0.020 LLP NZ HZ2 coval 0.960 0.020 LLP C4A NZ coval 1.330 0.020 LLP C4 C4A coval 1.500 0.020 LLP C3 C4 coval 1.390 0.020 LLP O3 C3 coval 1.230 0.020 LLP C2 C3 coval 1.390 0.020 LLP C2A C2 coval 1.500 0.020 LLP N1 C2 coval 1.380 0.020 LLP N1 C6 coval 1.380 0.020 LLP HN1 N1 coval 1.040 0.020 LLP C5 C4 coval 1.390 0.020 LLP C6 C5 coval 1.390 0.020 LLP H6 C6 coval 1.090 0.020 LLP C5A C5 coval 1.500 0.020 LLP O4P C5A coval 1.450 0.020 LLP P O4P coval 1.610 0.020 LLP O1P P coval 1.480 0.020 LLP O2P P coval 1.480 0.020 LLP O3P P coval 1.480 0.020 LLP CA C coval 1.525 0.021 LLP C O coval 1.231 0.020 loop_ _chem_comp_angle.comp_id _chem_comp_angle.atom_id_1 _chem_comp_angle.atom_id_2 _chem_comp_angle.atom_id_3 _chem_comp_angle.value_angle _chem_comp_angle.value_angle_esd LLP H N CA 114.000 3.000 LLP HA CA CB 109.000 3.000 LLP CB CA C 110.100 1.900 LLP HA CA C 109.000 3.000 LLP N CA HA 110.000 3.000 LLP N CA CB 110.500 1.700 LLP HB1 CB HB2 110.000 3.000 LLP HB2 CB CG 108.000 3.000 LLP HB1 CB CG 108.000 3.000 LLP CA CB HB1 109.000 3.000 LLP CA CB HB2 109.000 3.000 LLP CA CB CG 114.100 2.000 LLP HG1 CG HG2 110.000 3.000 LLP HG2 CG CD 108.000 3.000 LLP HG1 CG CD 108.000 3.000 LLP CB CG HG1 109.000 3.000 LLP CB CG HG2 109.000 3.000 LLP CB CG CD 111.300 2.300 LLP HD1 CD HD2 110.000 3.000 LLP HD2 CD CE 108.000 3.000 LLP HD1 CD CE 108.000 3.000 LLP CG CD HD1 109.000 3.000 LLP CG CD HD2 109.000 3.000 LLP CG CD CE 111.300 2.300 LLP HE1 CE HE2 110.000 3.000 LLP HE2 CE NZ 108.000 3.000 LLP HE1 CE NZ 108.000 3.000 LLP CD CE HE1 109.000 3.000 LLP CD CE HE2 109.000 3.000 LLP CD CE NZ 111.900 3.200 LLP HZ1 NZ HZ2 109.000 3.000 LLP HZ2 NZ C4A 109.000 3.000 LLP HZ1 NZ C4A 109.000 3.000 LLP CE NZ HZ1 110.000 3.000 LLP CE NZ HZ2 110.000 3.000 LLP CE NZ C4A 109.500 3.000 LLP NZ C4A C4 109.500 3.000 LLP C4A C4 C3 120.000 3.000 LLP C4A C4 C5 120.000 3.000 LLP C3 C4 C5 120.000 3.000 LLP C4 C3 O3 120.000 3.000 LLP C4 C3 C2 120.000 3.000 LLP O3 C3 C2 120.000 3.000 LLP C3 C2 C2A 120.000 3.000 LLP C3 C2 N1 120.000 3.000 LLP C2A C2 N1 120.000 3.000 LLP C2 N1 HN1 120.000 3.000 LLP C2 N1 C6 120.000 3.000 LLP HN1 N1 C6 120.000 3.000 LLP C4 C5 C6 120.000 3.000 LLP C4 C5 C5A 120.000 3.000 LLP C6 C5 C5A 120.000 3.000 LLP C5 C6 H6 120.000 3.000 LLP C5 C6 N1 120.000 3.000 LLP H6 C6 N1 120.000 3.000 LLP C5 C5A O4P 120.000 3.000 LLP C5A O4P P 120.000 3.000 LLP O4P P O1P 108.200 3.000 LLP O4P P O2P 108.200 3.000 LLP O4P P O3P 108.200 3.000 LLP O1P P O2P 119.900 3.000 LLP O1P P O3P 119.900 3.000 LLP O2P P O3P 119.900 3.000 LLP N CA C 111.200 2.800 LLP CA C O 120.800 1.700 loop_ _chem_comp_tor.comp_id _chem_comp_tor.id _chem_comp_tor.atom_id_1 _chem_comp_tor.atom_id_2 _chem_comp_tor.atom_id_3 _chem_comp_tor.atom_id_4 _chem_comp_tor.value_angle _chem_comp_tor.value_angle_esd _chem_comp_tor.period LLP chi1 N CA CB CG 180.000 15.000 3 LLP chi2 CA CB CG CD 180.000 15.000 3 LLP chi3 CB CG CD CE 180.000 15.000 3 LLP chi4 CG CD CE NZ 180.000 15.000 3 LLP var_1 CD CE NZ C4A 180.000 20.000 3 LLP var_2 CE NZ C4A C4 180.000 20.000 3 LLP var_3 NZ C4A C4 C5 -155.720 20.000 1 LLP CONST_1 C4A C4 C3 C2 180.000 0.000 0 LLP CONST_2 C4 C3 C2 N1 0.000 0.000 0 LLP CONST_3 C3 C2 N1 C6 0.000 0.000 0 LLP CONST_4 C4A C4 C5 C5A 0.000 0.000 0 LLP CONST_5 C4 C5 C6 N1 0.000 0.000 0 LLP var_6 C4 C5 C5A O4P 56.277 20.000 1 LLP var_7 C5 C5A O4P P -148.800 20.000 1 LLP var_8 C5A O4P P O3P -50.770 20.000 1 loop_ _chem_comp_chir.comp_id _chem_comp_chir.id _chem_comp_chir.atom_id_centre _chem_comp_chir.atom_id_1 _chem_comp_chir.atom_id_2 _chem_comp_chir.atom_id_3 _chem_comp_chir.volume_sign LLP chir_01 CA N CB C negativ loop_ _chem_comp_plane_atom.comp_id _chem_comp_plane_atom.plane_id _chem_comp_plane_atom.atom_id _chem_comp_plane_atom.dist_esd LLP plan-1 C2 0.020 LLP plan-1 N1 0.020 LLP plan-1 C2A 0.020 LLP plan-1 C3 0.020 LLP plan-1 C4 0.020 LLP plan-1 C5 0.020 LLP plan-1 C6 0.020 LLP plan-1 C4A 0.020 LLP plan-1 O3 0.020 LLP plan-1 C5A 0.020