# data_comp_list loop_ _chem_comp.id _chem_comp.three_letter_code _chem_comp.name _chem_comp.group _chem_comp.number_atoms_all _chem_comp.number_atoms_nh _chem_comp.desc_level GTP . 'GUANOSINE-5*-TRIPHOSPHATE ' non-polymer 48 32 . # data_comp_GTP # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.type_energy _chem_comp_atom.partial_charge GTP O6 O O 0.000 GTP C6 C CR6 0.000 GTP C5 C CR56 0.000 GTP C4 C CR56 0.000 GTP N3 N NR16 0.000 GTP C2 C CR6 0.000 GTP N2 N NH2 0.000 GTP HN22 H HNH2 0.000 GTP HN21 H HNH2 0.000 GTP N1 N NR16 0.000 GTP HN1 H HNR6 0.000 GTP N7 N NR15 0.000 GTP C8 C CR15 0.000 GTP H8 H HCR5 0.000 GTP N9 N NR5 0.000 GTP C1* C CH1 0.000 GTP H1* H HCH1 0.000 GTP C2* C CH1 0.000 GTP H2* H HCH1 0.000 GTP O2* O OH1 0.000 GTP HO2* H HOH1 0.000 GTP C3* C CH1 0.000 GTP H3* H HCH1 0.000 GTP O3* O OH1 0.000 GTP HO3* H HOH1 0.000 GTP O4* O O2 0.000 GTP C4* C CH1 0.000 GTP H4* H HCH1 0.000 GTP C5* C CH2 0.000 GTP H5*1 H HCH2 0.000 GTP H5*2 H HCH2 0.000 GTP O5* O O2 0.000 GTP PA P P 0.000 GTP O1A O OP 0.000 GTP O2A O OH1 0.000 GTP HOA2 H HOH1 0.000 GTP O3A O O2 0.000 GTP PB P P 0.000 GTP O1B O OP 0.000 GTP O2B O OH1 0.000 GTP HOB2 H HOH1 0.000 GTP O3B O O2 0.000 GTP PG P P 0.000 GTP O1G O OP 0.000 GTP O3G O OH1 0.000 GTP HOG3 H HOH1 0.000 GTP O2G O OH1 0.000 GTP HOG2 H HOH1 0.000 loop_ _chem_comp_tree.comp_id _chem_comp_tree.atom_id _chem_comp_tree.atom_back _chem_comp_tree.atom_forward _chem_comp_tree.connect_type GTP O6 n/a C6 START GTP C6 O6 C5 . GTP C5 C6 N7 . GTP C4 C5 N3 . GTP N3 C4 C2 . GTP C2 N3 N1 . GTP N2 C2 HN21 . GTP HN22 N2 . . GTP HN21 N2 . . GTP N1 C2 HN1 . GTP HN1 N1 . . GTP N7 C5 C8 . GTP C8 N7 N9 . GTP H8 C8 . . GTP N9 C8 C1* . GTP C1* N9 O4* . GTP H1* C1* . . GTP C2* C1* C3* . GTP H2* C2* . . GTP O2* C2* HO2* . GTP HO2* O2* . . GTP C3* C2* O3* . GTP H3* C3* . . GTP O3* C3* HO3* . GTP HO3* O3* . . GTP O4* C1* C4* . GTP C4* O4* C5* . GTP H4* C4* . . GTP C5* C4* O5* . GTP H5*1 C5* . . GTP H5*2 C5* . . GTP O5* C5* PA . GTP PA O5* O3A . GTP O1A PA . . GTP O2A PA HOA2 . GTP HOA2 O2A . . GTP O3A PA PB . GTP PB O3A O3B . GTP O1B PB . . GTP O2B PB HOB2 . GTP HOB2 O2B . . GTP O3B PB PG . GTP PG O3B O2G . GTP O1G PG . . GTP O3G PG HOG3 . GTP HOG3 O3G . . GTP O2G PG HOG2 . GTP HOG2 O2G . END GTP C4* C3* . ADD GTP N9 C4 . ADD GTP C6 N1 . ADD loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.type _chem_comp_bond.value_dist _chem_comp_bond.value_dist_esd GTP C6 O6 coval 1.230 0.020 GTP C6 N1 coval 1.380 0.020 GTP C5 C6 coval 1.390 0.020 GTP C4 C5 coval 1.390 0.020 GTP N3 C4 coval 1.355 0.020 GTP C2 N3 coval 1.380 0.020 GTP N2 C2 coval 1.330 0.020 GTP HN22 N2 coval 1.015 0.020 GTP HN21 N2 coval 1.015 0.020 GTP N1 C2 coval 1.380 0.020 GTP HN1 N1 coval 1.040 0.020 GTP N7 C5 coval 1.350 0.020 GTP C8 N7 coval 1.350 0.020 GTP H8 C8 coval 1.090 0.020 GTP N9 C8 coval 1.370 0.020 GTP N9 C4 coval 1.375 0.020 GTP C1* N9 coval 1.475 0.020 GTP H1* C1* coval 1.090 0.020 GTP C2* C1* coval 1.524 0.020 GTP H2* C2* coval 1.090 0.020 GTP O2* C2* coval 1.410 0.020 GTP HO2* O2* coval 0.980 0.020 GTP C3* C2* coval 1.524 0.020 GTP H3* C3* coval 1.090 0.020 GTP O3* C3* coval 1.410 0.020 GTP HO3* O3* coval 0.980 0.020 GTP O4* C1* coval 1.410 0.020 GTP C4* O4* coval 1.410 0.020 GTP C4* C3* coval 1.524 0.020 GTP H4* C4* coval 1.090 0.020 GTP C5* C4* coval 1.524 0.020 GTP H5*1 C5* coval 1.090 0.020 GTP H5*2 C5* coval 1.090 0.020 GTP O5* C5* coval 1.410 0.020 GTP PA O5* coval 1.610 0.020 GTP O1A PA coval 1.480 0.020 GTP O2A PA coval 1.540 0.020 GTP HOA2 O2A coval 0.980 0.020 GTP O3A PA coval 1.610 0.020 GTP PB O3A coval 1.610 0.020 GTP O1B PB coval 1.480 0.020 GTP O2B PB coval 1.540 0.020 GTP HOB2 O2B coval 0.980 0.020 GTP O3B PB coval 1.610 0.020 GTP PG O3B coval 1.610 0.020 GTP O1G PG coval 1.480 0.020 GTP O3G PG coval 1.540 0.020 GTP HOG3 O3G coval 0.980 0.020 GTP O2G PG coval 1.540 0.020 GTP HOG2 O2G coval 0.980 0.020 loop_ _chem_comp_angle.comp_id _chem_comp_angle.atom_id_1 _chem_comp_angle.atom_id_2 _chem_comp_angle.atom_id_3 _chem_comp_angle.value_angle _chem_comp_angle.value_angle_esd GTP O6 C6 C5 120.000 3.000 GTP O6 C6 N1 120.000 3.000 GTP C5 C6 N1 120.000 3.000 GTP C6 C5 C4 120.000 3.000 GTP C6 C5 N7 132.000 3.000 GTP C4 C5 N7 108.000 3.000 GTP C5 C4 N3 120.000 3.000 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3.000 GTP H3* C3* O3* 109.470 3.000 GTP H3* C3* C4* 108.340 3.000 GTP O3* C3* C4* 109.470 3.000 GTP C3* O3* HO3* 109.470 3.000 GTP C1* O4* C4* 111.800 3.000 GTP O4* C4* H4* 109.470 3.000 GTP O4* C4* C5* 109.470 3.000 GTP O4* C4* C3* 109.470 3.000 GTP H4* C4* C5* 108.340 3.000 GTP H4* C4* C3* 108.340 3.000 GTP C5* C4* C3* 111.000 3.000 GTP C4* C5* H5*1 109.470 3.000 GTP C4* C5* H5*2 109.470 3.000 GTP C4* C5* O5* 109.470 3.000 GTP H5*1 C5* H5*2 107.900 3.000 GTP H5*1 C5* O5* 109.470 3.000 GTP H5*2 C5* O5* 109.470 3.000 GTP C5* O5* PA 120.500 3.000 GTP O5* PA O1A 108.200 3.000 GTP O5* PA O2A 109.500 3.000 GTP O5* PA O3A 102.600 3.000 GTP O1A PA O2A 109.500 3.000 GTP O1A PA O3A 108.200 3.000 GTP O2A PA O3A 109.500 3.000 GTP PA O2A HOA2 120.000 3.000 GTP PA O3A PB 120.500 3.000 GTP O3A PB O1B 108.200 3.000 GTP O3A PB O2B 109.500 3.000 GTP O3A PB O3B 102.600 3.000 GTP O1B PB O2B 109.500 3.000 GTP O1B PB O3B 108.200 3.000 GTP O2B PB O3B 109.500 3.000 GTP PB O2B HOB2 120.000 3.000 GTP PB O3B PG 120.500 3.000 GTP O3B PG O1G 108.200 3.000 GTP O3B PG O3G 109.500 3.000 GTP O3B PG O2G 109.500 3.000 GTP O1G PG O3G 109.500 3.000 GTP O1G PG O2G 109.500 3.000 GTP O3G PG O2G 109.500 3.000 GTP PG O3G HOG3 120.000 3.000 GTP PG O2G HOG2 120.000 3.000 loop_ _chem_comp_tor.comp_id _chem_comp_tor.id _chem_comp_tor.atom_id_1 _chem_comp_tor.atom_id_2 _chem_comp_tor.atom_id_3 _chem_comp_tor.atom_id_4 _chem_comp_tor.value_angle _chem_comp_tor.value_angle_esd _chem_comp_tor.period GTP CONST_1 O6 C6 C5 N7 0.000 0.000 0 GTP CONST_2 C6 C5 C4 N3 0.000 0.000 0 GTP CONST_3 C6 C5 C4 N9 180.000 0.000 0 GTP CONST_4 C5 C4 N3 C2 0.000 0.000 0 GTP CONST_5 C4 N3 C2 N1 0.000 0.000 0 GTP var_1 N3 C2 N2 HN21 0.000 20.000 1 GTP CONST_6 N3 C2 N1 C6 0.000 0.000 0 GTP CONST_7 C6 C5 N7 C8 180.000 0.000 0 GTP CONST_8 C5 N7 C8 N9 0.000 0.000 0 GTP CONST_9 N7 C8 N9 C1* 180.000 0.000 0 GTP CONST_10 N7 C8 N9 C4 0.000 0.000 0 GTP var_2 C8 N9 C1* O4* -104.593 20.000 1 GTP var_3 N9 C1* C2* C3* 110.642 20.000 3 GTP var_4 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negativ GTP chir_03 C2* C3* O2* C1* negativ GTP chir_04 C1* O4* C2* N9 positiv loop_ _chem_comp_plane_atom.comp_id _chem_comp_plane_atom.plane_id _chem_comp_plane_atom.atom_id _chem_comp_plane_atom.dist_esd GTP plan-1 N9 0.020 GTP plan-1 C1* 0.020 GTP plan-1 C8 0.020 GTP plan-1 C4 0.020 GTP plan-1 N7 0.020 GTP plan-1 C5 0.020 GTP plan-1 C6 0.020 GTP plan-1 N1 0.020 GTP plan-1 C2 0.020 GTP plan-1 N3 0.020 GTP plan-1 N2 0.020 GTP plan-1 O6 0.020