# data_comp_list loop_ _chem_comp.id _chem_comp.three_letter_code _chem_comp.name _chem_comp.group _chem_comp.number_atoms_all _chem_comp.number_atoms_nh _chem_comp.desc_level CAP . '2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE ' non-polymer 35 21 . # data_comp_CAP # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.type_energy _chem_comp_atom.partial_charge CAP O4P O OP 0.000 CAP P2 P P 0.000 CAP O5P O OH1 0.000 CAP HOP5 H HOH1 0.000 CAP O6P O OH1 0.000 CAP HOP6 H HOH1 0.000 CAP O5 O O2 0.000 CAP C5 C CH2 0.000 CAP H51 H HCH2 0.000 CAP H52 H HCH2 0.000 CAP C4 C CH1 0.000 CAP H4 H HCH1 0.000 CAP O4 O OH1 0.000 CAP HO4 H HOH1 0.000 CAP C3 C CH1 0.000 CAP H3 H HCH1 0.000 CAP O3 O OH1 0.000 CAP HO3 H HOH1 0.000 CAP C2 C CT 0.000 CAP O2 O OH1 0.000 CAP HO2 H HOH1 0.000 CAP C C C 0.000 CAP O7 O OH1 0.000 CAP HO7 H HOH1 0.000 CAP O6 O O 0.000 CAP C1 C CH2 0.000 CAP H11 H HCH2 0.000 CAP H12 H HCH2 0.000 CAP O1 O O2 0.000 CAP P1 P P 0.000 CAP O1P O OP 0.000 CAP O3P O OH1 0.000 CAP HOP3 H HOH1 0.000 CAP O2P O OH1 0.000 CAP HOP2 H HOH1 0.000 loop_ _chem_comp_tree.comp_id _chem_comp_tree.atom_id _chem_comp_tree.atom_back _chem_comp_tree.atom_forward _chem_comp_tree.connect_type CAP O4P n/a P2 START CAP P2 O4P O5 . CAP O5P P2 HOP5 . CAP HOP5 O5P . . CAP O6P P2 HOP6 . CAP HOP6 O6P . . CAP O5 P2 C5 . CAP C5 O5 C4 . CAP H51 C5 . . CAP H52 C5 . . CAP C4 C5 C3 . CAP H4 C4 . . CAP O4 C4 HO4 . CAP HO4 O4 . . CAP C3 C4 C2 . CAP H3 C3 . . CAP O3 C3 HO3 . CAP HO3 O3 . . CAP C2 C3 C1 . CAP O2 C2 HO2 . CAP HO2 O2 . . CAP C C2 O6 . CAP O7 C HO7 . CAP HO7 O7 . . CAP O6 C . . CAP C1 C2 O1 . CAP H11 C1 . . CAP H12 C1 . . CAP O1 C1 P1 . CAP P1 O1 O2P . CAP O1P P1 . . CAP O3P P1 HOP3 . CAP HOP3 O3P . . CAP O2P P1 HOP2 . CAP HOP2 O2P . END loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.type _chem_comp_bond.value_dist _chem_comp_bond.value_dist_esd CAP P2 O4P coval 1.480 0.020 CAP O5P P2 coval 1.540 0.020 CAP HOP5 O5P coval 0.980 0.020 CAP O6P P2 coval 1.540 0.020 CAP HOP6 O6P coval 0.980 0.020 CAP O5 P2 coval 1.610 0.020 CAP C5 O5 coval 1.410 0.020 CAP H51 C5 coval 1.090 0.020 CAP H52 C5 coval 1.090 0.020 CAP C4 C5 coval 1.524 0.020 CAP H4 C4 coval 1.090 0.020 CAP O4 C4 coval 1.410 0.020 CAP HO4 O4 coval 0.980 0.020 CAP C3 C4 coval 1.524 0.020 CAP H3 C3 coval 1.090 0.020 CAP O3 C3 coval 1.410 0.020 CAP HO3 O3 coval 0.980 0.020 CAP C2 C3 coval 1.524 0.020 CAP O2 C2 coval 1.450 0.020 CAP HO2 O2 coval 0.980 0.020 CAP C C2 coval 1.520 0.020 CAP O7 C coval 1.310 0.020 CAP HO7 O7 coval 0.980 0.020 CAP O6 C coval 1.410 0.020 CAP C1 C2 coval 1.524 0.020 CAP H11 C1 coval 1.090 0.020 CAP H12 C1 coval 1.090 0.020 CAP O1 C1 coval 1.410 0.020 CAP P1 O1 coval 1.610 0.020 CAP O1P P1 coval 1.480 0.020 CAP O3P P1 coval 1.540 0.020 CAP HOP3 O3P coval 0.980 0.020 CAP O2P P1 coval 1.540 0.020 CAP HOP2 O2P coval 0.980 0.020 loop_ _chem_comp_angle.comp_id _chem_comp_angle.atom_id_1 _chem_comp_angle.atom_id_2 _chem_comp_angle.atom_id_3 _chem_comp_angle.value_angle _chem_comp_angle.value_angle_esd CAP O4P P2 O5P 109.500 3.000 CAP O4P P2 O6P 109.500 3.000 CAP O4P P2 O5 108.200 3.000 CAP O5P P2 O6P 109.500 3.000 CAP O5P P2 O5 109.500 3.000 CAP O6P P2 O5 109.500 3.000 CAP P2 O5P HOP5 120.000 3.000 CAP P2 O6P HOP6 120.000 3.000 CAP P2 O5 C5 120.500 3.000 CAP O5 C5 H51 109.470 3.000 CAP O5 C5 H52 109.470 3.000 CAP O5 C5 C4 109.470 3.000 CAP H51 C5 H52 107.900 3.000 CAP H51 C5 C4 109.470 3.000 CAP H52 C5 C4 109.470 3.000 CAP C5 C4 H4 108.340 3.000 CAP C5 C4 O4 109.470 3.000 CAP C5 C4 C3 111.000 3.000 CAP H4 C4 O4 109.470 3.000 CAP H4 C4 C3 108.340 3.000 CAP O4 C4 C3 109.470 3.000 CAP C4 O4 HO4 109.470 3.000 CAP C4 C3 H3 108.340 3.000 CAP C4 C3 O3 109.470 3.000 CAP C4 C3 C2 111.000 3.000 CAP H3 C3 O3 109.470 3.000 CAP H3 C3 C2 108.340 3.000 CAP O3 C3 C2 109.470 3.000 CAP C3 O3 HO3 109.470 3.000 CAP C3 C2 O2 109.470 3.000 CAP C3 C2 C 109.470 3.000 CAP C3 C2 C1 111.000 3.000 CAP O2 C2 C 109.470 3.000 CAP O2 C2 C1 109.470 3.000 CAP C C2 C1 109.470 3.000 CAP C2 O2 HO2 109.470 3.000 CAP C2 C O7 120.000 3.000 CAP C2 C O6 120.500 3.000 CAP O7 C O6 119.000 3.000 CAP C O7 HO7 109.470 3.000 CAP C2 C1 H11 109.470 3.000 CAP C2 C1 H12 109.470 3.000 CAP C2 C1 O1 109.500 3.000 CAP H11 C1 H12 107.900 3.000 CAP H11 C1 O1 109.470 3.000 CAP H12 C1 O1 109.470 3.000 CAP C1 O1 P1 120.500 3.000 CAP O1 P1 O1P 108.200 3.000 CAP O1 P1 O3P 109.500 3.000 CAP O1 P1 O2P 109.500 3.000 CAP O1P P1 O3P 109.500 3.000 CAP O1P P1 O2P 109.500 3.000 CAP O3P P1 O2P 109.500 3.000 CAP P1 O3P HOP3 120.000 3.000 CAP P1 O2P HOP2 120.000 3.000 loop_ _chem_comp_tor.comp_id _chem_comp_tor.id _chem_comp_tor.atom_id_1 _chem_comp_tor.atom_id_2 _chem_comp_tor.atom_id_3 _chem_comp_tor.atom_id_4 _chem_comp_tor.value_angle _chem_comp_tor.value_angle_esd _chem_comp_tor.period CAP var_1 O4P P2 O5P HOP5 0.000 20.000 1 CAP var_2 O4P P2 O6P HOP6 0.000 20.000 1 CAP var_3 O4P P2 O5 C5 160.556 20.000 1 CAP var_4 P2 O5 C5 C4 -115.831 20.000 1 CAP var_5 O5 C5 C4 C3 174.505 20.000 3 CAP var_6 C5 C4 O4 HO4 0.000 20.000 1 CAP var_7 C5 C4 C3 C2 145.716 20.000 3 CAP var_8 C4 C3 O3 HO3 0.000 20.000 1 CAP var_9 C4 C3 C2 C1 68.436 20.000 1 CAP var_10 C3 C2 O2 HO2 0.000 20.000 1 CAP var_11 C3 C2 C O6 -81.863 20.000 1 CAP var_12 C2 C O7 HO7 0.000 20.000 1 CAP var_13 C3 C2 C1 O1 172.972 20.000 1 CAP var_14 C2 C1 O1 P1 -179.250 20.000 1 CAP var_15 C1 O1 P1 O2P 53.659 20.000 1 CAP var_16 O1 P1 O3P HOP3 0.000 20.000 1 CAP var_17 O1 P1 O2P HOP2 0.000 20.000 1 loop_ _chem_comp_chir.comp_id _chem_comp_chir.id _chem_comp_chir.atom_id_centre _chem_comp_chir.atom_id_1 _chem_comp_chir.atom_id_2 _chem_comp_chir.atom_id_3 _chem_comp_chir.volume_sign CAP chir_01 C3 C2 C4 O3 negativ CAP chir_02 C4 C3 C5 O4 negativ loop_ _chem_comp_plane_atom.comp_id _chem_comp_plane_atom.plane_id _chem_comp_plane_atom.atom_id _chem_comp_plane_atom.dist_esd CAP plan-1 C 0.020 CAP plan-1 C2 0.020 CAP plan-1 O6 0.020 CAP plan-1 O7 0.020